課程資訊
課程名稱
結構生物資訊學
STRUCTURAL BIOINFORMATICS 
開課學期
95-1 
授課對象
生物資源暨農學院  生物產業機電工程學研究所  
授課教師
陳倩瑜 
課號
BME5412 
課程識別碼
631 U3140 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期三2,3,4(9:10~12:10) 
上課地點
知203 
備註
總人數上限:50人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/951StruBioinfo 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

此一課程在於介紹計算結構生物學
之演算法與生物研究相關之計算工
具及資料庫。 

課程目標
使學生獲得從事生物資訊研究必須
之基礎能力。 
課程要求
 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
每週一 11:00~12:00
每週二 11:00~12:00 
指定閱讀
 
參考書目
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
期中考 
30% 
 
2. 
期末專題 
30% 
 
3. 
作業 
40% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/20  Introduction to Structural Bioinformatics 
第2週
9/27  Protein sequences 
第3週
10/04  Incremental clustering 
第4週
10/11  Protein sequence clustering 
第5週
10/18  Defning similarity: sequence alignment 
第6週
10/25  Database serach: BLAST and FASTA 
第7週
11/01  Multiple sequence alignment and profiles 
第8週
11/08  Classification algorithms - Secondary structure prediction 
第9週
11/15  校慶 (當天停課) 
第10週
11/22  Feature selection for disorder prediction 
第11週
11/29  Midterm 
第12週
12/06  Sequential pattern mining 
第13週
12/13  Prediction of interacting sites 
第14週
12/20  Proten Structure Comparison 
第15週
12/27  Represent proposal of final project (protein-protein interaction) 
第16週
1/03  Optimization algorithm for protein-ligand docking 
第17週
1/10  Advance machine learning 
第18週
1/17  Demo of final project